博物馆先后被授予“全国中医药文化宣传教育基地”、 “四川省爱国主义教育基地”、“四川省科普基地”“四川省青少年爱国主义教育基地”、“成都市爱国主义教育基地”、“成都市科普基地”、“成都市科普场馆”“成都市青少年爱国主义教育基地” 、“中医药科技馆” 、“四川中医药科普教育基地”、“温江区科普教育基地”等称号。2016年四川省中医药管理局批准，四川省文化管理部门备案核定命名为“四川省中医药博物馆”。